動(dòng)物所等建立蛋白工程化改造新方法和基于Cas12i的基因編輯新工具
| 來源: 動(dòng)物研究所 【字號(hào):大 中 小】
CRISPR-Cas基因組編輯技術(shù)在基因治療、農(nóng)作物經(jīng)濟(jì)性狀改良及基礎(chǔ)研究等領(lǐng)域均有多樣化的應(yīng)用,引領(lǐng)生物技術(shù)與應(yīng)用的快速發(fā)展。自然界中廣泛存在的天然CRISPR-Cas系統(tǒng)為新型基因編輯工具研發(fā)提供了豐富資源。然而,自然界微生物中發(fā)現(xiàn)的大多數(shù)Cas工具蛋白在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的編輯效率較低,這限制了它們的應(yīng)用,尤其是在生物醫(yī)學(xué)方面的應(yīng)用。
中國(guó)科學(xué)院動(dòng)物研究所建立了一種蛋白質(zhì)工程化改造的新方法(Improving Editing Activity by Synergistic Engineering,簡(jiǎn)稱MIDAS),并利用該方法獲得了高活性的Cas12iMax以及高特異性的Cas12iHiFi等基因編輯新工具。
研究發(fā)現(xiàn),MIDAS方法能夠顯著提高來自不同CRISPR家族的Cas核酸酶,如Cas12i、Cas12b及CasX等CRISPR系統(tǒng)的基因編輯效率。其中,Cas12i由于較小的蛋白質(zhì)尺寸、簡(jiǎn)單的crRNA及PAM,具有較好的應(yīng)用潛力。通過MIDAS方法改造的Cas12i具有以下優(yōu)勢(shì)和特點(diǎn):Cas12iMax編輯效率非常高,相較于目前廣泛使用CRISPR基因編輯工具(AsCas12a、BhCas12b v4、SpCas9、SaCas9及SaCas9-KKH),展現(xiàn)了更高的平均基因編輯效率;Cas12iMax具有廣泛的基因組靶向范圍,能夠高效地識(shí)別NTNN、NNTN、NAAN及NCAN等PAM序列,可識(shí)別PAM覆蓋了70%的人基因組;在Cas12iMax的基礎(chǔ)上進(jìn)一步改造獲得了新的突變體Cas12iHiFi,Cas12iHiFi在全基因組范圍內(nèi)展現(xiàn)了的極高的特異性和極低的脫靶效應(yīng),同時(shí)保留Cas12iMax 90%的On-target基因編輯活性。
MIDAS方法有望在多種CRISPR系統(tǒng)的基因編輯工具化改造中發(fā)揮作用。該研究改造的新型Cas12i基因編輯工具在動(dòng)物模型制備、作物育種、醫(yī)學(xué)核酸檢測(cè)、基因治療等領(lǐng)域頗具應(yīng)用前景。
5月26日,相關(guān)研究成果發(fā)表在The Innovation上。該工作由動(dòng)物研究所和北京干細(xì)胞與再生醫(yī)學(xué)研究院完成。動(dòng)物所研究員周琪和李偉為論文的通訊作者,博士生陳陽燦、胡艷萍、王鑫閣為共同第一作者。研究工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、國(guó)家自然科學(xué)基金、中科院戰(zhàn)略性先導(dǎo)科技專項(xiàng)和中科院基礎(chǔ)研究青年團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目的支持。
開發(fā)新型蛋白質(zhì)工程化改造的方法,獲得高效基因組編輯工具Cas12i
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