科研進(jìn)展

精密測(cè)量院實(shí)現(xiàn)人源細(xì)胞內(nèi)的蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)及相互作用觀測(cè)

日期: 2023-04-14

|  來(lái)源: 精密測(cè)量科學(xué)與技術(shù)創(chuàng)新研究院 【字號(hào):

    近日,中國(guó)科學(xué)院精密測(cè)量科學(xué)與技術(shù)創(chuàng)新研究院研究員李從剛團(tuán)隊(duì)以高靈敏的19F化學(xué)標(biāo)記方法,結(jié)合電穿孔遞送技術(shù),實(shí)現(xiàn)了人源細(xì)胞內(nèi)6-40 kD的結(jié)構(gòu)蛋白觀測(cè),其檢測(cè)濃度低至1.0 μM,接近了部分蛋白質(zhì)的生理濃度。相關(guān)研究成果發(fā)表在《德國(guó)應(yīng)用化學(xué)》(Angew. Chem. Int. Ed.)上。

  活細(xì)胞核磁共振波譜可以提供細(xì)胞內(nèi)生物大分子原子分辨水平的結(jié)構(gòu)信息,是細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)研究的強(qiáng)有力工具。受制于核磁共振固有靈敏度低及細(xì)胞內(nèi)譜線增寬造成的低分辨率,目前的方法僅用于幾種豐度較高的小分子量蛋白質(zhì),對(duì)人源細(xì)胞中低豐度的大分子量蛋白質(zhì)則難以觀測(cè),嚴(yán)重阻礙其應(yīng)用。

  該研究發(fā)展的高靈敏探針wPSP-6F可以在溫和條件下,高效連接到蛋白質(zhì)半胱氨酸殘基上,形成的碳硫鍵在細(xì)胞內(nèi)非常穩(wěn)定。與常規(guī)的3-氟酪氨酸標(biāo)記相比,新探針的靈敏度提高了10倍以上(wPSP-6F探針標(biāo)記的GB1在30 min左右即可觀測(cè)到信噪比較高的核磁信號(hào),但是相同時(shí)間內(nèi)3-氟酪氨酸和15N標(biāo)記的GB1則無(wú)信號(hào))。

  除了較高的靈敏度,wPSP-6F探針同時(shí)具有較好的蛋白質(zhì)構(gòu)象分辨能力。以GB1突變體的二聚作用為例,19F信號(hào)可以在稀溶液或細(xì)胞內(nèi)很好地區(qū)分其單體和二聚構(gòu)象。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,細(xì)胞擁擠復(fù)雜的環(huán)境會(huì)極大地促進(jìn)蛋白的二聚,其二聚解離常數(shù)減小30倍,其中細(xì)胞內(nèi)非特異弱相互作用非常關(guān)鍵。

  蛋白質(zhì)的功能往往受到復(fù)雜細(xì)胞環(huán)境的調(diào)控,并在不同類(lèi)型的細(xì)胞中表現(xiàn)出差異。該工作所建立的高效19F標(biāo)記方法將拓展活細(xì)胞核磁共振的應(yīng)用場(chǎng)景和范圍,有望促進(jìn)人們?cè)谌嗽醇?xì)胞中近生理濃度下研究蛋白質(zhì)生物學(xué)功能和篩選相關(guān)藥物。

  相關(guān)研究工作得到國(guó)家自然科學(xué)基金和科學(xué)技術(shù)部重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃的支持。

  論文鏈接

  

wPSP-6F標(biāo)記可顯著提高信噪比并用于6-40 kD蛋白質(zhì)在細(xì)胞內(nèi)觀測(cè)

wPSP-6F標(biāo)記能有效區(qū)分蛋白二聚構(gòu)象并用于評(píng)估細(xì)胞環(huán)境對(duì)其結(jié)構(gòu)影響

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